נולד בליטא, שם רכש את השכלתו הרפואית ועלה לארץ-ישראל ביום י"ח בתמוז תרס"ב (23.7.1902). חיים השתקע בתל אביב, עבד כרופא מתנדב בארגון "הדסה" והתחבב על עמיתיו למקצוע ועל כל מכריו הרבים.

בפרוץ מלחמת העולם השניה, נענה ד"ר חיים פגירסקי לקריאת המוסדות הלאומיים והתנדב, כרופא, לצבא הבריטי. הוענקה לו דרגת לייטננט (סגן) והוא הוצב בבית חולים צבאי במדבר המערבי, לאחר זמן צורף כרופא ליחידה לוחמת. ביום כ"ב בשבט תש"ב (9.2.1942), נפטר והובא למנוחת עולמים בבית קברות צבאי בריטי באלכסנדריה, השאיר אשה ושני ילדים.

עוד על שירותו בצבא הבריטי:
חיים (יצחק) פגירסקי (Pagirski Issac (Chaim)), מספר אישי בריטי 202061. התגייס לצבא הבריטי והוצב בחיל הרפואה המלכותי הבריטי 
(R.A.M.C. - Royal Army Medical Corps). דרגתו בצבא הבריטי סגן (Lt. - Lieutenant). 
הובא למנוחות עולמים בבית הקברות הצבאי ALEXANDRIA (HADRA) WAR MEMORIAL CEMETERY, לוב. מיקום הקבר: 1. B. 16.